校章には波と翼がデザインされています。校名の「東海」である太平洋と、学園のシンボルかもめをあしらったものです。洋洋とした太平洋のように大きく豊かな心を持って、空高くから見渡し、ゆったりと大きく翼を広げて飛翔するかもめの姿は、東海大学の理想を象徴しています。その上の文字は、教育機関である大学・高等学校・中等部・小学校・幼稚園を表しています。

創立者松前重義博士は、思想家内村鑑三の影響から「愛と正義」を自らの信条とし、学園の校旗の十字に象徴化しました。そして、「校旗の十字の白線は、横が愛、縦は正義を表す。愛と正義の交わるところに真理がある。」と述べています。

校旗の地色は学園の教育機関の幼・小・中・高・短大・大学・大学院の七段階に対応して、それぞれ赤・橙・黄・緑・青・藍・紫の七色に分けられています。これは虹の七色を意味しています。七色の光が渾然（こんぜん）と融合して太陽の白光となり、それが地上に降り注ぐとき、万物は生育するのです。それに象徴されるように、七種の学校群が一体となった教育を行うことによって一人ひとりの中に豊かな生命が育まれるように、という願いがこめられているのです。したがって、本校の校旗も中等部は黄(写真左側)と高等学校は緑(写真右側)の地色にそれぞれ白色で十字が描かれています。